九部联军浩浩荡荡袭来之事很快就被建州女真左卫侦查兵发现，他们立刻跑去禀报明龙虎将军佟努尔哈赤，得知敌军兵力是他的三倍！这让佟努尔哈赤开始害怕起来，连忙写信让士兵出城去传报明抚顺游击李永芳，让他通知明辽东巡抚尤继。

然而明辽东巡抚顾及建州左卫乃是大明帝国的管辖卫所，便任命抚顺守御千户所派出1千明军前去调解情况，明军快速前往佛阿拉城去帮助建州女真左卫军队。

但叶赫女真已经下令攻城的九部联军迅速突破各个关卡，建州女真左卫士兵被迫退入古勒山，佟努尔哈赤很是愤怒他集中1万兵力攻其主力叶赫女真斩杀西城贝勒！

又在明军的支援下生擒乌拉贝勒，其余七部联军见到有明军介入纷纷撤退，就这样佟努尔哈赤打败了九部联军在女真各部威名大增，史称〖九部联军之战〗之后佟努尔哈赤为了感激明军的帮助，就带领使者第三次去京城朝贡大明天子。

到了明万历二十二年公元1594年明蓟辽总督顾养谦，与力主对倭议和封贡的明兵部尚书石星，再次上奏明神宗请求尽快封贡安土桃山幕府。

并说道“启奏陛下，当初幕府倭军攻占李氏朝鲜是利用其威！如今及时退还王京、送回王子和陪臣是讲信用，陛下既然许诺分封则当尽快册封倭使，好让倭寇尽早退出李氏朝鲜，方可保外患平息内备以修，今倭军久住釜山而我大明欲封不封？既已失信！”

此话让明神宗觉得有理就让司礼监太监传诏幕府使者小西如安，火速进京确认御旨双方在太仆寺谈判，大明官员提出说“我皇陛下让我们来传话，令幕府倭军尽早退出李氏朝鲜，若你们执意不退的话？那么我朝则兴兵正罪势必要剿灭你们。”

但小西如安就提出道“大和语我军在受封之后可以迅速撤离李氏朝鲜和吕宋都督府与琉球王国，但是咱们只册封而不准朝廷求进贡，其次朝廷必须与李氏朝鲜修好不得侵犯我国。”

由于明使不太懂大和语！小西如安就和沈惟敬一起欺瞒明使，为了稳住他们就谎称皆以稳妥，并传递幕府的降书给明兵部尚书观看，不明真相的明兵部尚书大喜，在场的大明官员很是高兴连忙上奏明神宗，又带着倭使进宫向大明天子献礼。

同时明神宗赐封明临淮候勋卫署都督佥事李宗城，为正使、明五军营右副将署都督佥事杨方亨，为副使两人同封为一品武官，并带着（亲王常服）与冠冕前往李氏朝鲜釜山，在从此地出使安土桃山幕府。

明万历二十三年公元1595年明兵部左侍郎邢玠，命令明重庆知府王士，让明播州宣慰使杨应龙，到秦江县听勘而明播州宣慰使就把黄元等12个叛将斩杀，并献首级请纳银四万两助采木赎罪。

见到他有心悔过被朝廷允准，但是明神宗为防止他继续造反就以杨应龙长子杨朝栋，代替其职，并把杨应龙的二子杨可栋，扣留在四川承宣布政司重庆府作为人质。

然而好景不长杨可栋突然病死？杨应龙得知自己二子死去的消息就怀疑是大明官员毒害的？他当即拒绝缴赎金为此又激起朝廷的猜忌。

同时明建州左卫镇抚爱新觉罗·舒尔哈齐，首次带领建州女真左卫使团前往京城朝贡，这次经历让他大开眼界看着中原地区的繁华景象，在想想建州左卫蛮荒部落地区，他开始对自己屈居在兄长的属下地位感到不满，他希望有朝一日能当上建州女真左卫指挥使，他还对中原先进的农耕文明和汉文化产生了浓厚兴趣。

为此还特意在京城订制了一件汉服，并且亲自穿着汉服入朝觐见大明天子，朝中的文武百官见状纷纷夸赞这是建州女真八部里面最有汉文化之人了，穿着冕服的明神宗也很赏识舒尔哈齐，赐了他许多珠宝给建州女真左卫朝贡使。

之后明万历二十四年公元1596年明播州宣慰使再次起兵叛乱率军