之后9月朝廷就升明山东布政司左参政铁铉，为〈山东左布政使〉，并改命明山东都指挥使盛庸，代替明曹国公李景隆，继续抵抗燕军南侵。

12月初8明安陆侯吴杰、明后军都督府都督佥事兼北平行都指挥使平安，防两人防守定州，明山东都指挥使驻扎在刚刚收复的德州卫，明万全都指挥使徐凯，则屯兵在沧州，三方互为掎角。

燕军首先袭击沧州擒获明万全都指挥使，夺其辎重进逼济宁卫，明山东都指挥使立即率军驻扎在东昌府进行拦击背城列阵，明燕武亲王率军铁骑直逼山东明军的左翼，但山东明军变换阵形临危不惧。

接着燕军又冲其中军，明山东都指挥使很自信的张开队列放燕军进来，再用兵收拢层层包围，燕军中军主将张玉、燕军北平都指挥佥事朱能，率领兀良哈三卫骑兵来救，与明燕武亲王会合拼死突围而出。

但燕军中军主将却不知燕亲王殿下已被救出，仍在阵中冲杀最终力竭被明军长矛队包围刺落下马而死，时年58岁！

导致燕军大败，许多燕军被明军火器所伤，只有明燕武亲王以数百名骑兵殿后，才能安然退至山东承宣布政使司馆陶县，可依旧被明山东都指挥使传令明安陆侯、明北平行都指挥使从真定府抄近路拦截燕军归路。

然而待得胜捷报回去朝廷之时，却遭到了明惠宗的反感与大怒，因为之前自己下令削藩已经逼死了一个十二皇叔明湘献亲王朱柏，眼下要是在害死四皇叔燕武亲王朱棣，的话那么自己就是千古罪人了！

故此他下了一道诏令去前线，让围剿燕军的明军们有些懵圈？他的一道圣旨“朕要见到活的叔父押来应天府。”

才因此使得明燕武亲王逃过了多次被围困的劫难，正是明惠宗的这种妇人之仁最终将朝廷推向了深渊。

在明建文三年公元1401年正月由于明军不敢过多围攻燕军，才让燕军得以喘息过来，朝廷经过兵部商议不得不重新启用明兵部左侍郎齐泰、明翰林院大学士黄澄，官复原职留朝参政。

紧跟着明安陆侯、明北平行都指挥使两人在深州之战中失利，燕军才得以返回，在这次战役中燕军精锐几乎丧失殆尽，幸亏明山东都指挥使及时赶到打退燕军声威大振，明惠宗亲自为此祭庙告捷。

3月燕军又南出保定府，明山东都指挥使则扎营在夹河，被明燕武亲王轻率骑兵来探掠阵而过偷袭侧营，气得明山东都指挥使立刻派遣千名骑兵追击，还反被燕军射箭击退。

双方交战过后明山东都指挥使军持盾而进，明燕武亲王则命步兵先攻，骑兵则乘机迅速推进，明山东都指挥使大怒亲率军力战，斩其燕军北行都指挥同知谭渊。

而燕军左军都指挥使朱能、燕军万全都指挥同知张武，等部将也率部殊死战斗，明燕武亲王则以轻骑穿越阵地与燕军左军都指挥使会合，明山东都指挥使的援军明山西行都指挥使庄得、明河南都指挥使皂旗张，等将领战死，但是燕军在这一天内也死伤惨重几乎大败。

第二天再战燕军在东北，明山东都指挥使在西南，从早晨战至下午双方互有胜负，待两军都已疲惫之时，将士们各自坐下休息。

随后又开始交战，忽然东北风大起，飞尘遮蔽天空，燕军乘风大喊左右横击，打得明山东都指挥使大败逃回德州卫从此气沮不已，燕军山东都指挥佥事李远，在沛县焚毁明军运粮船只，使得明军缺乏粮饷不敢轻易出兵。

燕军才能继续组织军队大规模南下，败明山东都指挥使于滹沱河，再败明安陆侯于藁城，朝廷震怒直接让明兵部左侍郎在外募师勤王。

当时明燕武亲王虽多胜但也损失颇重，而朝廷军源颇广不必担心，燕军在北平行都指挥使司、山东承宣布政使司一带所攻下的城邑，等军撤回后又被朝廷军队所占据。

5月朝廷辽东明