此时明云南税监矿使杨荣，非但不悬崖勒马，改弦更张，反而还怙恶不悛，先将孝敬财宝不足的几位知府投入比刑部牢狱，还惨毒百倍的北镇抚司锦衣卫「诏狱」。

还将抗击开矿的明越州卫指挥使樊高明，打断肋骨后戴枷示众，又以求马不获继续毒虐，残酷杀害居民数千人，又进一步以取马四十匹不足数为由，擅自逮捕了明平夷卫指挥使贺瑞凤，且令明广南卫指挥使于可继，等人大肆宣称要尽捕；云南前卫、云南后卫、云南左卫、云南右卫、云南中卫、曲靖卫，这六个卫的将领问罪。

弄得人人自危！

3月11日，明云南前卫指挥使贺世勋、明曲靖卫指挥使韩光大，等将领忍无可忍，带领冤民万余人，冲入杨矿税使的官署，放火焚烧，并杀死杨荣，为民申冤，还斩杀其党二百余人，释放奴隶百人。

明神宗朱翊钧，得知明云南税监矿使被杀后，数日不进食，且欲逮问守土官，但经过明东阁大学士沈鲤，再三劝解，以及明司礼监左少监陈矩，详细分析利害，明神宗才怒气稍消，命令只杀明云南前卫指挥使一人。

4月初9日，因贵州承宣布政使司石阡府苗民长官使司有叛变行为，故此明贵州总镇巡抚郭子章，就命明贵州总镇总兵陈璘，率部一万人攻打苗民长官使司附近的水硍山。

攻克了水硍山之后，又移师到新添屯，独攻东路，又攻克后，苗民长官使司完全与外界切断，才安定下来投降明军。

5月13日，参加万历朝鲜战争的福建承宣布政使司漳州府漳浦县同里人士，明镇海卫守备刘志迈，被罢回家之后，与明同里庠生程可兆，等人暗中组织群众千余人，共图起事。

5月18日晚，刘志迈带领众人在漳浦县城教场上祭旗，约定于第二天发动起事，却不料遇大风雨，便改为5月25日，并分众人各自二百人于城内外相互呼应。

同里百姓李调梅，得知此消息后，密告明漳浦县知县黄应举，让他主持公道。

6月初6日，缅甸军民宣慰使司东吁王朝出动大军三十万人，围攻木邦军民宣慰使司都城，明木邦军民宣慰使罕钦叔，向大明帝国云南承宣布政使司内地请救兵，结果明军兵未至而城陷。

缅甸军民宣慰使司兼东吁王朝国主底哈都拉摩诃达马亚扎（汉名莽良渊）立孟密宣抚使思礼，领其众由此木邦军民宣慰使司遂亡。

7月16日，明东阁大学士沈鲤，上奏明神宗各大尚书要职以及六部、都察院左右侍郎官员欠缺，又遇明刑科给事中周日庠，上奏说九卿官员欠缺，明工科给事中王元翰，论朝政说明神宗不上朝凡事交由内阁处理导致许多大臣们，都见不到皇帝一面，忠臣无法报效朝廷！并让明神宗下「罪己诏」被皇帝拒绝。

8月21日，在陕西承宣布政使司延安府绥德州米脂县河西200里的李继迁寨，一户穷苦李姓人家里出生了一个小孩，排名老大叫（李鸿基）他的父亲李守忠，老来得子也算是福气。

李继迁寨距他的老家长峁鄢村60多里，这里在三百年前属于大宋皇朝附属国西夏王国地界，是西夏景宗西平王烈皇帝李元昊，建国之处世代族人都属于北魏鲜卑拓拔氏党项族后裔居住地。

9月初6日，明漳浦县知县黄应举，经过一番策划调兵后，采取了封闭城门，大肆搜捕，把叛逆程可兆，等十余人抓捕归案。

次日在城外的刘志迈知事已败，随即逃遁而去。

9月18日，在陕西都指挥使司延绥总镇榆林卫旧安边营柳树涧堡，一户卖猪肉的屠夫张快，人家出生了孩子，因排名老八，且是由偏房沈氏，所生故此取名为（张敬轩）也因家境贫寒且边境时常遭遇袄儿都指挥使司河套部蒙古铁骑入侵，使得张快家业破产。

其子女八人与其偏房，一起沦落到了靠卖草鞋、卖红枣，的地步